Épidémiologie classique et moléculaire des infections émergentes au Québec

Mon programme de recherche évaluative et épidémiologique s’articule autour de deux grands thèmes centrés sur des infections émergentes en Estrie : 1) Recherche évaluative populationnelle en immunisationProjet en cours (investigateur principal, GlaxoSmithKline, 200 798$, Investigator-Sponsored Studies Program) afin d'évaluer l’impact du programme de vaccination universel contre la varicelle sur l’incidence du zona sévère dans la MRC de Sherbrooke et de valider la banque de données MED-ECHO dans ce contexte. Ce projet permettra de guider l’instauration d’un futur programme d’immunisation contre le zona au Québec et servira d’assisse à un programme plus large évaluant l’impact populationnel de programmes d’immunisation sur d’autres maladies évitables. Je développerai une méthode permettant d’estimer adéquatement le nombre de cas d’infections rencontrées en communauté et qui seront par la suite hospitalisés. Ces estimations permettront aussi de mieux évaluer le fardeau de l’infection et de raffiner les paramètres des analyses économiques utilisées dans l'évaluation des programme d'immunisation. 2) Impact des changements climatiques sur l’incidence et la sévérité d’infections communautaires à réservoir environnemental Projet rétrospectif multicentrique panquébécois (financement de 297 000$ de l’Agence de santé publique du Canada à titre de chercheur principal à l'été 2018 – Fonds du programme de maladies infectieuses et de changements climatiques) sur l’épidémiologie clinique et moléculaire de l’infection fongique à Blastomyces dermatitidis. Ce champignon, est responsable d’infections pulmonaires, mais aussi multisystémiques, et associé à un taux de mortalité de 25%. Le nombre de cas a connu une augmentation importante au Québec au cours des dernières années. Ce projet couple les données cliniques de tous les cas recensés au Québec depuis 1988 à l’analyse génotypique d’une banque d’isolats de 213 souches de B. dermatitidis, en collaboration avec le Laboratoire de santé publique du Québec. Le projet déterminera le rôle des facteurs de virulence, des facteurs de l’hôte et de l’environnement dans l’émergence de ce pathogène et l’augmentation de la sévérité observée. Ce projet, qui servira de fondement à des études rétrospectives de grande envergure et à logistique complexe, est mené dans 33 installations différentes. Le modèle développé sera aussi utilisé dans une série de projet sur la maladie de Lyme et d'autres maladies vectorielles (ex : virus du Nil occidental et autres aorbovirus). Je m'intéresse aussi, en collaboration avec la Faculté de génie, à l'impact des inondations sur l'incidece et la sévérité de différentes maladies infectieuses.

• Chercheur de l'année, Centre de recherche du CHUS. https://us8.campaign-archive.com/?u=cd2f3c59c4d38daf0718d60bf&id=02063d6ecc
• Mérite Estrien -La Tribune- 20 juin 2020. https://www.latribune.ca/actualites/merite-estrien/de-chercheur-a-vulgarisateur-0b47464fbf8d7e029ffd29611ebb0bb6

• Protection against omicron (B.1.1.529) BA.2 reinfection conferred by primary omicron BA.1 or pre-omicron SARS-CoV-2 infection among health-care workers with and without mRNA vaccination: a test-negative case-control study
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 01-01-23
  Hyperlien :https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85143500868&origin=inward
• Two-Dose Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 Vaccine Effectiveness With Mixed Schedules and Extended Dosing Intervals: Test-Negative Design Studies From British Columbia and Quebec, Canada
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 30-11-22
  Hyperlien :https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85143180315&origin=inward
• Estimated Protection of Prior SARS-CoV-2 Infection Against Reinfection With the Omicron Variant Among Messenger RNA-Vaccinated and Nonvaccinated Individuals in Quebec, Canada
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 03-10-22
  Hyperlien :https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85139889190&origin=inward
• Single-Dose Messenger RNA Vaccine Effectiveness Against Severe Acute Respiratory Syndrome Coronavirus 2 in Healthcare Workers Extending 16 Weeks Postvaccination: A Test-Negative Design From Québec, Canada
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 24-08-22
  Hyperlien :https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85137124699&origin=inward
• Low-dose trimethoprim-sulfamethoxazole for the treatment of Pneumocystis jirovecii pneumonia (LOW-TMP): protocol for a phase III randomised, placebo-controlled, dose-comparison trial
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 21-07-22
  Hyperlien :https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85134789709&origin=inward
• Identification d'un agrégat inhabituel d'anaplasmose granulocytaire humaine dans la région de l'Estrie, Québec, Canada, en 2021
  Type de publication : Article de revue
  Date de parution : 05-05-22
  Hyperlien :https://www.canada.ca/fr/sante-publique/services/rapports-publications/releve-maladies-transmissibles-canada-rmtc/numero-mensuel/2022-48/numero-5-mai-2022/anaplasmose-granulocytaire-humaine-estrie-quebec.html
• Management and clinical outcomes of Lyme disease in acute care facilities in 2 endemic regions of Quebec, Canada: a multicentre retrospective cohort study
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 01-04-22
  Hyperlien :https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85133106117&origin=inward
• Séroprévalence du SRAS-CoV-2 chez les travailleurs de la santé de 10 hôpitaux du Québec, au Canada: étude transversale
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 07-03-22
  Hyperlien :https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85125973572&origin=inward
• Impact and benefit-cost ratio of a program for the management of latent tuberculosis infection among refugees in a region of Canada
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 01-01-22
  Hyperlien :https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85130767189&origin=inward
• Detection of severe acute respiratory syndrome coronavirus 2 (SARS-CoV-2) and its first variants in fourplex real-time quantitative reverse transcription-PCR assays
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 01-01-22
  Hyperlien :https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85123215088&origin=inward
• SARS-CoV-2 seroprevalence in health care workers from 10 hospitals in Quebec, Canada: a cross-sectional study
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 13-12-21
  Hyperlien :https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85121700109&origin=inward
• Changing patterns of disease severity in blastomyces dermatitidis infection, quebec, canada
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 01-11-21
  Hyperlien :https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85117962632&origin=inward
• Validation of algorithms using International Classification of Diseases for the identification of herpes zoster episodes requiring hospitalization in Quebec, Canada
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 01-10-21
  Hyperlien :https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85115651789&origin=inward
• Clinical impact of accepting or rejecting a recommendation from a clinical decision support system–assisted antibiotic stewardship program
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 01-06-21
  Hyperlien :https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85111417778&origin=inward
• In subjects 16 years of age and older, is messenger RNA vaccine BNT162b2 against COVID-19 effective and safe?
  Type de publication : Lettre à l'éditeur
  Date de parution : 01-03-21
  Hyperlien :https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85101413163&origin=inward
• Does BCG provide long-term protection against SARS-CoV-2 infection? A case–control study in Quebec, Canada
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 01-01-21
  Hyperlien :https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85114352928&origin=inward
• Validation of saliva sampling as an alternative to oro-nasopharyngeal swab for detection of SARS-CoV-2 using unextracted rRT-PCR with the Allplex 2019-nCoV assay
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 01-01-21
  Hyperlien :https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85113314477&origin=inward
• Respiratory tract samples collected from patients in a region of Quebec, Canada, indicate the absence of early circulation of SARS-CoV-2 infection
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 01-12-20
  Hyperlien :https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85099540867&origin=inward
• Anosmie et dysgueusie associées à l’infection au SRAS-CoV-2: étude cas–témoins appariée selon l’âge
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 16-11-20
  Hyperlien :https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85096270788&origin=inward
• Is antimicrobial dosing adjustment associated with better outcomes in patients with severe obesity and bloodstream infections? An exploratory study
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 01-10-20
  Hyperlien :https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85092590513&origin=inward
• Anosmia and dysgeusia associated with SARS-CoV-2 infection: an age-matched case-control study
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 29-06-20
  Hyperlien :https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85087434761&origin=inward
• Letter: The Risk of COVID-19 Infection During Neurosurgical Procedures: A Review of Severe Acute Respiratory Distress Syndrome Coronavirus 2 (SARS-CoV-2) Modes of Transmission and Proposed Neurosurgery-Specific Measures for Mitigation
  Type de publication : Article de journaux
  Date de parution : 26-04-20
  Hyperlien :https://www.scopus.com/record/display.uri?eid=2-s2.0-85084617718&origin=inward